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python生成20个随机的DNA fasta格式文件
生成20个随机的文件, 由于没有用到hash名字,文件名有可能会重复
每个文件中有30-50条序列
每条序列的长度为70-120个碱基
import os import random import string print (dir(string)) letter = string.ascii_letters os.chdir("D:\\") bases = {1:"A", 2:"T", 3:"C", 4:"G"} ## Test random module , get random DNA base Nth = random.randint(1,4) print (bases[Nth]) ## Create random DNA sequences for i in range(20): Number_of_Seq = random.randint(30,50) filename = letter[i] with open("Sequences"+filename + str(Number_of_Seq)+ ".fasta", "w") as file_output: for j in range(Number_of_Seq): each_Seq="" Rand_len = random.randint(70,120) for k in range(Rand_len): Nth = random.randint(1,4) each_Seq += bases[Nth] file_output.write(">seq_"+str(Number_of_Seq)+ "_"+str(Rand_len)+"\n") file_output.write(each_Seq+"\n")
python生成20个随机的DNA fasta格式文件
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