一、在Myeclipse中新建项目一般会有下列四种libraries：

  JRE System Library , java EE 6 Libraries , Referenced Libraries，Web App  Libraries

二、各种libraries含义
  JRE System Library: 指Java SE 的常用库文件集合,建立普通的Java项目均会使用; 

  java EE 6 Libraries: 指Java EE的常用库文件的集合,建立Web项目会用到这个库集合与Java SE的库文件集合;
  Referenced Libraries: 指你项目中所使用的第三方库文件集合.如果你把项目所需要的其他JAR包直接加在 项  目->属性->Java Build Path -> Libraries 中的时候,MyEclipse 会自动将这些JAR包归类到一个集合中, 并取名为 Referenced Libraries , 显示在项目中.
       问： 经常在SSH中出现jar包冲突 不知是Referenced Libraries 中的jar文件冲突 还是 WebRoot /web-inf/ lib 下jar文件冲突？？？
      解答：编译期冲突是由Referenced Libraries中jar包冲突引起；运行期冲突是由 WebRoot /web-inf/ lib 下jar文件冲突引起的。首先 Referenced Libraries可以是引用 WebRoot /web-inf/ lib下的jar包，也可以是其他从别的地方复制过来的第三方jar包。 Referenced Libraries是编译环境下使用的JAR包, 所谓编译环境下使用的JAR包, 就是说你在Eclipse中进行源文件的编写的时候, 所需要引用到的类都从Referenced Libraries这个集合中的JAR包中拿; WebRoot /web-inf/lib中的JAR包是运行时环境下使用的JAR包, 所谓运行时环境下使用的JAR包,就是说你在运行你的项目的时候所需要使用的JAR包的集合; 注意区分两种环境:编译环境与运行环境.

   Web App  Libraries：This container dynamically manages classpath entries for types in the WEB-INF/lib and WEB-INF/classes directories. 相信有点英语基础的的人都能看的懂。
   关于web项目没有看到Web App  Libraries，可以通过右键项目/built path/Configure built path/点击libraries标签  选择右边的add  library按钮 ，在弹出的窗口中选择Web App Libraries添加即可。
转自：http://blog.sina.com.cn/u/2147192277

Myeclipse中各种Library的含义