首页 > 代码库 > 一般分析任务运行内存大小
一般分析任务运行内存大小
1 QC:逐条过滤,内存不大,如果是压缩文件取决于缓冲大小,一般设置1G;
2 SOAPAligner:比对需要读入reference,取决于reference大小,比较大的如人类hg19和细菌,设置15G左右;
3 SOAP denovo:组装软件,取决于数据量,大约设置为数据量的10倍,一般高通量数据一个sample以4G算的话,设置40G等;
4 velvet:组装软件,比SOAP denovo耗内存要多一些,在SOAP基础上按需增加,一般比Soapdenovo多设置50%;
5 预测,MetaGeneMark:内存消耗很小,1-2G足够;
一般分析任务运行内存大小
声明:以上内容来自用户投稿及互联网公开渠道收集整理发布,本网站不拥有所有权,未作人工编辑处理,也不承担相关法律责任,若内容有误或涉及侵权可进行投诉: 投诉/举报 工作人员会在5个工作日内联系你,一经查实,本站将立刻删除涉嫌侵权内容。