首页 > 代码库 > 一般分析任务运行内存大小

一般分析任务运行内存大小

1  QC:逐条过滤,内存不大,如果是压缩文件取决于缓冲大小,一般设置1G;

2  SOAPAligner:比对需要读入reference,取决于reference大小,比较大的如人类hg19和细菌,设置15G左右;

3  SOAP denovo:组装软件,取决于数据量,大约设置为数据量的10倍,一般高通量数据一个sample以4G算的话,设置40G等;

4  velvet:组装软件,比SOAP denovo耗内存要多一些,在SOAP基础上按需增加,一般比Soapdenovo多设置50%;

5  预测,MetaGeneMark:内存消耗很小,1-2G足够;

一般分析任务运行内存大小