这个问题找到原因了：是工程编译的时候没有设置line number，导致调试的时候无法定位，关键是：这个line number设置是针对某个工程的，而不是整个平台的环境变量 ，所以才会出现有的工程行，有的工程不行的情况。坑爹的是，这个问题居然没有任何提示，也不知道什么时候勾掉的。
废话不多说了，解决方法如下：
选定工程，点击右键-->Properties-->Java Compiler-->Classfile Generation，勾选上Add line number attributes to generated class files(used by the debugger)。
然后就可以了