缘由: 在查询Mysql中的数据库，或者修改比较大的表的时候就会出现这种情况；
google之：
方案1.在mysql配置文件[myslqd]下面添加一行设置skip-name-resolve.需要重启mysql服务.
 
方案2.在hosts文件内添加:　ip与主机名的映射关系,如: 127.0.0.1 localhost.　这种方式不用重启mysql服务.
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三个层面上解决这个问题：
1. 代码层面，你需要在自己的PHP数据库连接处增加大致如下代码。
if( in_array(mysql_errno(), array(2006, 2013))){
         mysql_close();
         mysql_connect(...);
        mysql_query(...);
}
也就是说遇到2006,2013错误就重新连接一下MySQL。
2. MySQL层面，需要配置一些参数 my.cnf （但是这里是linux下，我的windows配置怎么办？）
wait_timeout = x 超时时间 如600秒
max_allowed_packet = y 最大允许数据量
适当增加x,y的值。
3. 一般出现这种情况不是所有例句而是单个表，请你先修复表一般都能解决这类问题。
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MySQL Error 2013: Lost connection to MySQL server during query
错误代码: 1153 - Got a packet bigger than ‘max_allowed_packet‘ bytes
解决方法：
修改mysql.ini（网上都说是这个文件，找了N久终于知道在哪里了，我的目录是在 D:\MySQL_Data\MySQL Server 5.5 在MySQL_Data文件夹下）文件添加如下代码即可
max_allowed_packet=500M

如果不可以的话就修改D:\MySQL\MySQL Server 5.5\my-huge.ini
里的max_allowed_packet=16M 把16改为500
我是根据此方法做的，试试
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4. 可以直接在mysql中设置：
#show variables like ‘%timeout%‘;
#show variables like ‘max_allowed_packet‘
set global wait_timeout=60000;
#set global max_allowed_packet = 2*1024*1024

Mysql mysql lost connection to server during query 问题解决方法