以2.7升级到3.3为例
1.删除原版本
a)删除系统库中的版本
sudo rm -R /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7 
b)删除Current版本
sudo rm /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/Current
c)删除/usr/bin目录下的python相关文件
find . -name "py*" -print| xargs rm -rf

2.下载并安装指定的python版本
到python官网下载要安装的版本，并且安装

3.链接系统库中的Python版本
a)链接库文件，先将新安装的版本移动到系统版本目录下
sudo mv /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.3 /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions 
b)重新链接Current版本
sudo ln -s /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.3 /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/Current
c)重新链接/usr/bin/下的Python相关的文件
sudo ln -s /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.3/bin/pydoc3.3 /usr/bin/pydoc
sudo ln -s /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.3/bin/python3.3 /usr/bin/python
sudo ln -s /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.3/bin/pythonw3.3 /usr/bin/pythonw
sudo ln -s /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.3/bin/python3.3m-config /usr/bin/python-config
4.重置环境变量（.bash_profile）
PYTHON=$/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/bin:$PATH

PLUS:有提到要修改group权限
sudo chown -R root:wheel /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.3

reference:

http://blog.163.com/zhou_li12/blog/static/18498031120140190282974/