1 MyISAM只把索引载入内存，数据缓存依赖于操作系统，InnoDB把索引和数据都载入内存缓冲 

2 MyISAM数据库中的数据是按照插入的顺序保存，在每个索引节点中保存对应的数据行的地址，理论上说主键索引和其他索引是一样的，InnoDB数据库中的数据和主键节点保存在一起，所有其他索引节点中保存的是主键索引的值。 

3 对于字符串索引，MyISAM默认采用增量保存，例如第一个索引值是‘perform‘，第二个索引的值是‘performance‘, 在索引文件中第二个索引被保存为‘7,ance‘。这样能够减小索引的尺寸。 

4 MyISAM保存索引的状态信息在磁盘里，每次执行ANALYZE TABLE会更新这个信息。InnoDB则通过在启动的时候随机读取索引来估计索引的状态信息，所以Show Index的结果对于MyISAM是精准的，但对于InnoDB不是绝对精准。 

5 索引长期运行之后会产生碎片，一种碎片是一行数据被保存在不同的数据段，另一种是连续的表空间或行在磁盘上被分散地保存。对于MyISAM两种索引碎片都会出现，对于InnoDB只会出现后一种因为InnoDB不会把短行保存到不同的数据段。要消除索引碎片一种方法是OPTIMIZE TABLE,另一种方法是把数据重新倒入。 

针对MyISAM和InnoDB不同的索引结构，要注意以下几点： 

1 在InnoDB表中插入数据一定要尽可能按照主键增加的顺序，AUTO_INCREMENT最好，这样插入的速度最快 

2 因为InnoDB索引节点中保存的是主键的值，所以主键的值越简单越好 

3 对于InnoDB表，在查询的时候如果只需要查找索引列，就不要加入其它列，这样速度最快。

MyISAM和InnoDB的索引在实现上的不同