一般出现在从别处检出或者导入import的项目上，只有项目文件夹上有红叉，其他地方都正常，现总结个人的几个解决方案：

有几种可能：
1，编码设置是否一致，也即是你项目原来的编码和现在eclipse用的默认编码是否一致
2，导入项目中jar路径可能已经被改变，多数情况下都是这个原因造成，我也曾经遇见过，你要确保你的jar包路径都没问题。myeclipse有查看jar路径的视图你可切换看看，报红X的就都是路径被改动过的，重新加进来就OK。
3，在problem控制台里有如下错误提示：Java compiler level does not match the version of the installed Java project facet。这种情况一般可以在项目上右键-->properties-->然后找到project facets和 Java Compiler两个选项，修改其使用的jdk版本即可。

项目文件夹上有红叉，其他地方都正常