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centos7 下安装生物信息软件的问题小总结
1、安装samtools与bwa时:
缺少zlib库
下载zlib库
cd zlib/CFLAGS="-O3 -fPIC" ./configuremakemake install
然后在进入samtools 进行make
2、安装rpm包是 依赖而不能安装!
rpm -ivh xxx.rpm --nodeps --force
先强制安装!
再用rpm -qa |grep xx 查找已经安装
ldd查找需要的
注:1.加上 --nodeps,意思不考虑依赖
2.更狠的--force,强制安装
可以在这两个之前试试--aid自己解决依赖
3、安装soapsnp是遇到缺少boost
先配置boost
下载boost 解压
1 ./booststria.sh2 ./bjam -s HAVE_ICU=13 ./bjam install --prefix=/usr
第一步完后生成bjam脚本
其中第二步大约需要半个小时!
将当前目录下编译好的头文件安装到相应位置:在/usr/include下有头文件夹boost,在/usr/lib下有boost的库
未完待续。。。
centos7 下安装生物信息软件的问题小总结
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