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Hadoop实现全排序
1、1TB(或1分钟)排序的冠军
作为分布式数据处理的框架,集群的数据处理能力究竟有多快?或许1TB排序可以作为衡量的标准之一。
1TB排序,就是对1TB(1024GB,大约100亿行数据)的数据进行排序。2008年,Hadoop赢得1TB排序基准评估第一名,排序1TB数据耗时209秒。后来,1TB排序被1分钟排序所取代,1分钟排序指的是在一分钟内尽可能多的排序。2009年,在一个1406个节点组成的hadoop集群,在59秒里对500GB完成了排序;而在1460个节点的集群,排序1TB数据只花了62秒。
这么惊人的数据处理能力,是不是让你印象深刻呢?呵呵
下面我们来看看排序的过程吧。
2、排序的过程
1TB的数据?100亿条数据?都是什么样的数据呢?让我们来看几条:
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描述一下:每一行,是一条数据。每一条,由2部分组成,前面是一个由10个随即字符组成的key,后面是一个80个字符组成的value。
排序的任务:按照key的顺序排。
那么1TB的数据从何而来?答案是用程序随即生成的,用一个只有map,没有reduce的MapReduce job,在整个集群上先随即生成100亿行数据。然后,在这个基础上,再运行排序的MapReduce job,以测试集群排序性能。
3、排序的原理
先说明一点,熟悉MapReduce的人都知道:排序是MapReduce的天然特性!在数据达到reducer之前,mapreduce框架已经对这些数据按键排序了。
所以,在这个排序的job里,不需要特殊的Mapper和Reducer类。用默认的
IdentityMapper和IdentityReducer即可。
既然排序是天然特性,那么1TB排序的难点在哪里呢??答:100亿行的数据随即分散在1000多台机器上,mapper和reducer都是Identity的,这个难点就在MapReduce的shuffle阶段!关键在如何取样和怎么写Partitioner。
好在这个排序的源代码已近包含在hadoop的examples里了,下面我们就来分析一下。
4、取样和partition的过程
面对对这么大量的数据,为了partition的更均匀。要先“取样”:
1) 对Math.min(10, splits.length)个split(输入分片)进行随机取样,总共10万个样,对每个split取10000个(split数目达到10个及以上时候, added by jiwan)。
2) 10万个样排序,根据reducer的数量(n),取出将所有10万个样平均分隔的n-1个样
3) 将这个n-1个样写入partitionFile(_partition.lst,是一个SequenceFile),key是取的样,值是nullValue
4) 将partitionFile写入DistributedCache
接下来,正式开始执行MapReduce job:
5) 每个map节点:
a.根据n-1个样,build一棵类似于B-数的“索引树”:
* 每个非叶子节点,都有256个子节点(应为2^8=256, added by jiwan)。
* 不算根节点的非叶子节点有1层,加上根节点和叶子节点,共3层。
* 非叶子节点代表key的“byte path”
* 每个叶子节点代表key的前2个bytes path
* 叶子节点上,保存的是partition number的范围,有多少个reducer就有多少partition number
b.前缀相同的key,被分配到同一个叶子节点。
c.一个子节点上,可能有多个reducer
d.比第i个样小的key,被分配到第i个reducer,剩下的被分配到最后一个reducer。
6) 针对一个key,partition的过程:
a. 首选判断key的第1个byte,找到第1层非叶子节点
b. 再根据key的第2个byte,叶子节点
c. 每个叶子节点可能对应多个取样(即多个reducer),再逐个和每个样比较,确定分配给哪一个reducer
5、图解partition的“索引树”
对上面的文字描述可能比较难理解,etongg 同学建议我画个图。所有才有了下面这些文字。感谢etongg和大家对本帖的关注。
“索引树”的作用是为了让key快速找到对应的reducer。下图是我画的索引树示意图:
对上面的图做一点解释:
1、为了简单,我只画了A、B、C三个节点,实际的是有256个节点的。
2、这个图假设有20个reducer(下标0到19),那么我们最终获得n-1个样,即19个样(下标为18的为最后一个样)
3、图中的圆圈,代表索引树上的节点,索引树共3层。
4、叶子节点下面的长方形代表取样数组。红色的数字代表取样的下标。
5、每个节点都对应取样数组上的一个下标范围(更准备的说,是对应一个partition number的范围,每个partition number代表一个reducer)。这个范围在途中用蓝色的文字标识。
前面文中有一句话:
比第i个样小的key,被分配到第i个reducer,剩下的被分配到最后一个reducer
这里做一个小小的纠正,应该是:
小于或者等于第i个样的key,被分配到第i个reducer,剩下的被分配到最后一个reducer。
下面开始partition:
如果key以"AAA"开头,被分配到第“0”个reducer。
如果key以"ACA"开头,被分配到第“4”个reducer。
如果key以"ACD"开头,被分配到第“4”个reducer。
如果key以"ACF"开头,被分配到第“5”个reducer。
那么,
如果key以"ACZ"开头,被分配到第几个reducer??
答案是:被分配到第“6”个reducer。
同理,
如果key以"CCZ"开头,被分配到第“19”个reducer,也就是最后一个reducer。
6、为什么不用HashPartitioner?
还需要再说明的一点:
上面自定义的Partitinoner的作用除了快速找到key对应的reducer,更重要的一点是:这个Partitioner控制了排序的总体有序!
上文中提到的“排序是MapReduce的天然特性!”这句话有点迷惑性。更准确的说,这个“天然特性”只保证了:a) 每个map的输出结果是有序的; b) 每个reduce的输入是有序的(参考下面的图)。而1TB的整体有序还需要靠Partitioner的帮助!
Partitioner控制了相似的key(即前缀相同)落在同一个reducer里,然后mapreduce的“天然特性”再保证每个reducer的输入(在正式执行reduce函数前,有一个排序的动作)是有序的!
这样就理解了为什么不能用HashPartitioiner了。因为自定义的Partitioner要保证排序的“整体有序”大方向。
另外,推荐一篇关于partitioner博文:Hadoop Tutorial Series, Issue #2: Getting Started With (Customized) Partitioning
再贴《Hadoop.The.Definitive.Guide》中一张图,更有利于理解了:
具体实现:
分为两步:取样+Partition对每条数据做标记(即发往哪个reducer做处理)
1. 取样
原理:取样工作在JobClient端进行,目的是取出n-1个、排序好的样本(可以划分出n个reducer),在partition的过程中,通过将当前keyvalue对的key跟样本中数据作比较,就可以知道该keyvalue对发往哪个reducer了。
以此我们需要写自己的“取样类”:
static class TextSampler implements IndexedSortable { public ArrayList<IntWritable> records = new ArrayList<IntWritable>();//全部样本数据 @Override public int compare(int arg0, int arg1) { IntWritable right = records.get(arg0); IntWritable left = records.get(arg1); return right.compareTo(left); } @Override public void swap(int arg0, int arg1) { IntWritable right = records.get(arg0); IntWritable left = records.get(arg1); records.set(arg0, left); records.set(arg1, right); } public void addKey(IntWritable key) { records.add(key); } public IntWritable[] createPartitions(int numPartitions) { int numRecords = records.size(); if (numPartitions > numRecords) { throw new IllegalArgumentException("Requested more partitions than input keys (" + numPartitions + " > " + numRecords + ")"); } new QuickSort().sort(this, 0, records.size()); float stepSize = numRecords / (float) numPartitions;//取数的步长 IntWritable[] result = new IntWritable[numPartitions - 1]; for (int i = 1; i < numPartitions; ++i) { result[i - 1] = records.get(Math.round(stepSize * i));//从全部样本数据中再抽出n-1个样本 } return result; } }
说明:实现了IndexedSortable接口,IndexedSortable接口是Hadoop中的排序器,Hadoop关于可排序的数据集定义了一个抽象接口IndexedSortable,也就是说任何能够排序的数据集必须要实现两个方法,一是能够比较它的数据集中任意两项的大小,二是能够交换它的数据集中任意两项的位置。实现了这个接口我们就可以使用hadoop预定义的快排进行排序。如上:new QuickSort().sort(this, 0, records.size());
那么样本怎么得来的呢?
我们需要从分片中获得,在Job启动前必须得到n-1个取样数据——>需要对输入的数据进行控制——>需要自定义实现InputFormat接口的类。InputFormat做了2件事:
(1)InputSplit[] getSplits(JobConf job, int numSplits) throws IOException; 得到划分
(2)RecordReader<K, V> getRecordReader(InputSplit split, JobConf job, Reporter reporter) throws IOException; 处理每个划分,对每个划分的数据生成KeyValue对
分片不用重写。需要自定义实现RecordReader接口的类。
static class TeraRecordReader implements RecordReader<IntWritable, Text> { private LineRecordReader in; private LongWritable junk = new LongWritable(); private Text line = new Text(); public TeraRecordReader(Configuration job, FileSplit split) throws IOException { in = new LineRecordReader(job, split); } @Override public void close() throws IOException { in.close(); } @Override public IntWritable createKey() { return new IntWritable(); } @Override public Text createValue() { return new Text(); } @Override public long getPos() throws IOException { // TODO Auto-generated method stub return in.getPos(); } @Override public float getProgress() throws IOException { // TODO Auto-generated method stub return in.getProgress(); } @Override public boolean next(IntWritable key, Text value) throws IOException { if (in.next(junk, line)) { key.set(Integer.parseInt(line.toString())); value.clear(); return true; } else { return false; } } }//end RecordReader
默认情况下会对每个分片中的每行数据得到一个形如<Key=该行的起始位置:LongWritable,Value=http://www.mamicode.com/该行的内容的:Text>的KeyValue对,我们需要将这个KeyValue对转化成我们想要的形式
到此我们可以按格式读到RecordReader提供的KeyValue对了。那么接下来我们就要找到读到的数据中你认为可以当做样本的数据:
public static void writePartitionFile(JobConf conf, Path partFile) throws IOException { SamplerInputFormat inputFormat = new SamplerInputFormat(); TextSampler sampler = new TextSampler(); int partitions = conf.getNumReduceTasks(); // Reducer任务的个数 long sampleSize = conf.getLong(SAMPLE_SIZE, 100); // 采集数据-键值对的个数 InputSplit[] splits = inputFormat.getSplits(conf, conf.getNumMapTasks());// 获得数据分片 int samples = Math.min(10, splits.length);// 采集分片的个数 long recordsPerSample = sampleSize / samples;// 每个分片采集的键值对个数 int sampleStep = splits.length / samples; // 采集分片的步长 long records = 0; IntWritable key = new IntWritable(); Text value = new Text(); for (int i = 0; i < samples; i++) { //to particular split construct a record_reader RecordReader<IntWritable, Text> reader = inputFormat.getRecordReader(splits[sampleStep * i], conf, null); while (reader.next(key, value)) { sampler.addKey(key); key=new IntWritable(); value = new Text(); records += 1; if ((i + 1) * recordsPerSample <= records) { break; } } } FileSystem outFs = partFile.getFileSystem(conf); if (outFs.exists(partFile)) { outFs.delete(partFile, false); } SequenceFile.Writer writer = SequenceFile.createWriter(outFs, conf, partFile, IntWritable.class, NullWritable.class); NullWritable nullValue = NullWritable.get(); for (IntWritable split : sampler.createPartitions(partitions)) { writer.append(split, nullValue); } writer.close(); }
如上所示,我们通过writer将(n-1)个样本写入到了临时的样本文件中。接下来可以启动Job了。
3. Partition对每条数据做标记(即发往哪个reducer做处理)
在map-reduce流程中,partitioner会负责“告知”每条数据的归属地reducer,这里我们要根据上面写好的临时样本文件判断每天数据的归属,因此需要自定义实现Partitioner接口的类:
// 自定义的Partitioner public static class TotalOrderPartitioner implements Partitioner<IntWritable, NullWritable> { private IntWritable[] splitPoints; public TotalOrderPartitioner() { } @Override public int getPartition(IntWritable key, NullWritable value, int numReduceTasks) { // TODO Auto-generated method stub return findPartition(key); } public void configure(JobConf conf) { try { FileSystem fs = FileSystem.get(conf); Path partFile = new Path(SamplerInputFormat.PARTITION_FILENAME); splitPoints = readPartitions(fs, partFile, conf,splitPoints); // 读取采集文件 } catch (IOException ie) { throw new IllegalArgumentException("can‘t read paritions file", ie); } } //通过找区间的方式定位partition public int findPartition(IntWritable key) { int len = splitPoints.length; for (int i = 0; i < len; i++) { int res = key.compareTo(splitPoints[i]); if (res > 0 && i < len - 1) { continue; } else if (res == 0) { return i; } else if (res < 0) { return i; } else if (res > 0 && i == len - 1) { return i + 1; } } return 0; } private static IntWritable[] readPartitions(FileSystem fs, Path p, JobConf job, IntWritable[] splitPoints) throws IOException { URI[] uris = DistributedCache.getCacheFiles(fs.getConf()); SequenceFile.Reader reader = new SequenceFile.Reader(fs, new Path(uris[0]), job); ArrayList<IntWritable> parts = new ArrayList<IntWritable>(); IntWritable key = new IntWritable(); NullWritable value = NullWritable.get(); while (reader.next(key, value)) { parts.add(key); key=new IntWritable(); value = NullWritable.get(); } reader.close(); splitPoints = new IntWritable[parts.size()]; for(int i=0;i<parts.size();i++) { splitPoints[i] = parts.get(i); } return splitPoints; } }
如上所示,一个自定义的Partitioner只需要实现两个功能:getPartition()和configure()。
(1)getPartition()函数返回一个0到(Reducer数目-1)之间的int值来确定将<key,value>键值对送到哪一个Reducer中。
(2)configure()使用Hadoop Job Configuration来配置partitioner,并读取样本数据。
至此,我们控制了哪些数据发往哪些reducer,且这种控制是有序的控制,在每个reducer中的数据,hadoop会自动实现排序,因此整体上实现了全排序。
以上是整形的全排序,字符串的全排序与此大同小异。
注意:伪分布式reducer的个数只能是0或1,无法设置reducer的个数。
无论字符串排序还是整型排序都是在job启动前先把采样的样本放到SequenceFile中,然后job开始后,读取SequenceFile中的样本数据到一维数组中。之后,
(1)如果是字符串排序,既可以使用字符串比较的方法通过查找区间来定位partition,也可以通过构建2层字典树(terasort中使用的方法)定位partition;
(2)如果是整形排序,就直接按找区间的方法定位partition;
Hadoop实现全排序