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python 的 class
虽然python OOP 是可选的,但是尽可能使用OOP, 可以让你的代码更精简,容易理解。
python 中大多数OOP故事, 都可简化为这个表达式:
object.attribute
类的建立使用class 语句
类中的赋值语句对应属性
类中的函数对应方法
每次从类中产生实例时, python 会自动调用__init__的方法, 实例会自动传给self.
类中的方法第一个参数,一定是self, 实例将会传给self.
区分类对象和实例对象, 用class语句的时候产生类对象,并将这个类对象付给变量名。
eg:
class miao(): #这是产生了一个类对象,并且将这个对象赋给了miao这个变量名。
type(miao) 会返回<type ‘classobj‘>, 即类对象
当你创建一个实例的时候, 产生了实例对象, 每个实例对象继承了类的属性并获得了自己的命名空间, 你在实例的命名空间里进行赋值操作不会影响到这个实例的类中的属性。
类是模块内的属性,你当然可以通过模块导入类。
>>> class miao: pass # 世界上最简单的类,这个类里什么都没有
...
>>> miao.name = ‘freemao‘ #对这类添加属性
>>> miao.love = ‘xinxin‘
>>> me = miao() #一个实例
>>> me.name #实例继承了你刚才为类添加的属性
‘freemao‘
>>> me.love
‘xinxin‘
>>> me.name = ‘miaochenyong‘ #在实例的命名空间里也添加了name属性
>>> me.name #在搜索name的时候肯定是先搜索自己的命名空间, 没有了再去搜索上面类的
‘miaochenyong‘
>>> miao.name
‘freemao‘
看一个对象的属性调用__dict__ 方法。
>>> miao.__dict__ #查看miao这个类的属性, 返回一个字典
{‘__module__‘: ‘__main__‘, ‘love‘: ‘xinxin‘, ‘__doc__‘: None, ‘name‘: ‘freemao‘}
>>> me.__dict__ #查看me这个实例的属性,只有一个属性。
{‘name‘: ‘miaochenyong‘}
>>> miao.__dict__.keys() #只看键。
[‘__module__‘, ‘love‘, ‘__doc__‘, ‘name‘]
创建子类:
>>> class miaochenyong(miao): #创建一个miaochenyong类,他是miao的子类, miao的所有属性他都有,但是他可以个性化的定制些自己的
... real = ‘real miaochenyong‘ #real是miaochenyong的属性,不是miao的。
...
>>> yeye = miaochenyong #创建一个实例,这个实例具有miaochenyong的属性, 也具有miao的属性,在搜索的时候,会先搜索miaochenyong, miaochenyong没有了才会去搜索miao
>>> yeye.real #yeye这个实例继承了miaochenyong的real属性
‘real miaochenyong‘
>>> yeye.name #yeye也继承了miao的name属性
‘freemao‘
__class__ 可以看这个实例是来自于哪个类
>>> me.__class__
<class __main__.miao at 0x2b936642bbf0>
一个简单的例子, 注意return的运用:
class Person:
def __init__(self, name, job=None, pay=0): #对参数设置默认值,因为刚开始实例并不一定有这些参数。。。
self.name = name
self.job = job
self.pay = pay
def lastname(self): #这个方法返回name的lastname
return self.name.split()[-1]
def giveRaise(self, percent):
self.pay = self.pay * (1+percent) #改变了self.pay的值, 在原始的基础上增加了
def __str__(self):
return ‘Person: %s, %s‘ %(self.name, self.pay)
类不像你想想的那样难!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
目标,建立一个超类: 提供提取各种不同版本vcf文件中的Chr, pos, Rbase, Abase, genotype.
再建立三个子类, 分别取提取fb, gatk, sb的vcf文件中的DP, R-count, A-count.
github地址: