准备工作
配置防火墙，开启80端口、3306端口
删除原有的 iptables , 添加合适的配置

rm -rf /etc/sysconfig/iptables
vi /etc/sysconfig/iptables
添加如下内容 :

################################ 添加好之后防火墙规则如下所示################################
# Firewall configuration written by system-config-firewall
# Manual customization of this file is not recommended.
*filter
:INPUT ACCEPT [0:0]
:FORWARD ACCEPT [0:0]
:OUTPUT ACCEPT [0:0]
-A INPUT -m state --state ESTABLISHED,RELATED -j ACCEPT
-A INPUT -p icmp -j ACCEPT
-A INPUT -i lo -j ACCEPT
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 22 -j ACCEPT
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 80 -j ACCEPT
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 3306 -j ACCEPT
-A INPUT -j REJECT --reject-with icmp-host-prohibited
-A FORWARD -j REJECT --reject-with icmp-host-prohibited
COMMIT
#######################################################################################
:wq保存退出, 重启防火墙使配置生效

/etc/init.d/iptables restart
关闭SELINUX

rm -rf /etc/selinux/config
vi /etc/selinux/config
添加一行内容:

SELINUX=disabled
:wq保存退出

#重启系统
shutdown -r now
安装第三方yum源
#安装下载工具
yum install wget
#下载
wget http://www.atomicorp.com/installers/atomic
#安装
sh ./atomic
#更新yum源
yum check-update
开始安装
一. 安装nginx
#删除系统自带的软件包
yum remove httpd* php*
#安装nginx
yum install -y nginx
#设置nginx开机启动
chkconfig nginx on
#启动nginx
service nginx start
二. 安装PHP
检查当前安装的PHP包
yum list installed | grep php
如果有安装的PHP包，先删除他们, 如:
yum remove php.x86_64 php-cli.x86_64 php-common.x86_64
配置安装包源:
# Centos 5.X
rpm -Uvh http://mirror.webtatic.com/yum/el5/latest.rpm
# CentOs 6.x
rpm -Uvh http://mirror.webtatic.com/yum/el6/latest.rpm
# CentOs 7.X
rpm -Uvh https://mirror.webtatic.com/yum/el7/epel-release.rpm
rpm -Uvh https://mirror.webtatic.com/yum/el7/webtatic-release.rpm
如果想删除上面安装的包，重新安装
rpm -qa | grep webstatic
rpm -e [上面搜索到的包即可]
执行安装
yum -y install php56w.x86_64
yum -y --enablerepo=webtatic install php56w-devel

yum -y install php56w-gd.x86_64 php56w-ldap.x86_64 php56w-mbstring.x86_64 php56w-mcrypt.x86_64 php56w-mysql.x86_64 php56w-pdo.x86_64 php56w-opcache.x86_64 php56w-imap.x86_64 php56w-odbc.x86_64 php56w-pear.x86_64 php56w-xml.x86_64 php56w-xmlrpc.x86_64 php56w-bcmath.x86_64 php56w-mhash.x86_64 libmcrypt.x86_64?

安装PHP FPM
yum -y install php56w-fpm
#设置php-fpm开机启动
chkconfig php-fpm on
#启动php-fpm
/etc/init.d/php-fpm start
注：如果想更换到php5.5或5.4版本, 直接把上面的56w换成55w或者54w就可以了
三. 安装 MySQL
安装
yum install -y mysql mysql-server
#启动MySQL
/etc/init.d/mysqld start
#设为开机启动
chkconfig mysqld on
#拷贝配置文件（注意：如果/etc目录下面默认有一个my.cnf，直接覆盖即可）
cp /usr/share/mysql/my-medium.cnf /etc/my.cnf
为root账户设置密码
mysql_secure_installation
# 回车，根据提示输入Y，输入2次密码，回车，根据提示一路输入Y，最后出现：Thanks for using MySQL!
# MySql密码设置完成，重新启动 MySQL：
#重启
/etc/init.d/mysqld restart
#停止
/etc/init.d/mysqld stop
#启动
/etc/init.d/mysqld start
配置
1. 配置nginx
rm -rf /etc/nginx/conf.d/*
vi /etc/nginx/conf.d/default.conf
添加如下内容 :

server{
listen 80;
server_name _;
index index.php index.html index.htm;
root /var/www;

location ~ .*\.(php|php5)?$
{
#fastcgi_pass unix:/tmp/php-cgi.sock;
fastcgi_pass 127.0.0.1:9000;
fastcgi_index index.php;
include fastcgi.conf;
}

location / {
try_files $uri $uri/ /index.php?$query_string;
}
}
说明: /var/www 为web根目录, location / ... 为url的rewrite,隐藏 index.php

2. 配置php-fpm
vi /etc/php-fpm.d/www.conf
将用户和用户组设置为nginx, 如:

#修改用户为nginx
user = nginx
#修改组为nginx
group = nginx
开始测试
cd /var/www
vi index.php
添加以下代码

<?php
phpinfo();
?>
:wq! 保存退出

#设置权限
 chown nginx.nginx /var/www -R 
#重启nginx
 service nginx restart 
#重启php-fpm
 service php-fpm restart 
在客户端浏览器输入服务器IP地址(如: 127.0.0.1)，可以看到相关的配置信息！
说明lnmp配置成功！

500错误
我也遇到了同样的问题，找了两天错误，原来是因为根目录下storage没有写权限，运行chmod -R 777 storage就正常显示了

centos6.5下使用yum搭建LNMP环境(php5.6)