由于引用的FluentNhibernate使用的Nhibernate是另外一个版本的，而自己添加的版本是不同版本，导致此问题。NuGet重新添加最新版本的FluentNhibernate。

或者在配置文件中添加版本重定向，new VerSion为自己添加Nhibernate版本，oldVersion为FluentNhiberbate使用的版本

<configuration>
<runtime>
<assemblyBinding xmlns="urn:schemas-microsoft-com:asm.v1" >
<dependentAssembly>
<assemblyIdentity name="NHibernate" publicKeyToken="aa95f207798dfdb4" />
<bindingRedirect oldVersion="3.0.0.2001" newVersion="3.3.1.4000" />
</dependentAssembly>
</assemblyBinding>
</runtime>
</configuration>

引用的Nhibernate程序集版本和FluentNhibernate使用的Nhibernate版本不一致，导致未能加载文件或程序集“NHibernate, Version=3.0.0.2001错误