Java调用r主要有三种方式，rJava，rServer还有rCaller，这边主要讲用rJava调用

rJava是一个R语言和Java语言的通信接口，通过底层JNI实现调用，允许在R中直接调用Java的对象和方法。由于rJava是底层接口，并使用JNI作为接口调用，所以效率非常高。在JRI的方案中，JVM直接通过内存直接加载RVM，调用过程性能几乎无损耗，因此是非常高效连接通道，是R和Java通信的首选开发包。

之前用R3.0.2，不知道是否是版本太高的原因，

利用rjava实现java调用R的过程中，像打印变量，这些都可以成功
String version = re.eval("R.version.string").asString();System.out.println(version);
定义变量的情况也可以
REXP x=re.eval("1:10");
System.out.println("REXP result = "+x);
re.eval("print(1:10/3)");

但是涉及到调用基本函数的时候，却是总报空指针的错误。
比如
re.eval("rnorm(10)");
double[] arr =re.eval("rnorm(10)").asDoubleArray();

或者是自带的测试代码中的
REXP x;
re.eval("data(iris)",false);
System.out.println(x=re.eval("iris"));

进入正题，首先打开R软件，

install.packages("rJava")

如果library(rJava)不报错，说明第一步成功了。

启动jvm

.jinit()

s <- .jnew("java/lang/String", "Hello World!")

s

[1] "Java-Object{Hello World!}"

然后设置环境变量
CLASSPATH=D:\proSoftware\R-2.15.0\library\rJava\jri;
PATH=D:\proSoftware\R-2.15.0\bin\i386
R_HOME=D:\proSoftware\R-2.15.0\R-2.15.0\

将D:\proSoftware\R-2.15.0\library\rJava\jri下的三个jar包（JRIEngine.jar，JRI.jar，REngine.jar）拷到C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_10\lib目录下，即jdk目录的lib下

打开eclipse，创建Java project。同时将上述三个包导入工程中。

D:\proSoftware\R-2.15.0\library\rJava\jri\examples目录下有两个自带测试代码rtest.java和rtest2.java。

运行这两个代码，如果结果不报错，说明调用成功。

运行之前记得run configurations中添加VM参数设置为 -Djava.library.path=D:\proSoftware\R-2.15.0\library\rJava\jri

R与java整合