var firstInterval;
var secondInterval;

function firstAlert(){
     if(firstInterval) clearInterval(firstInterval);//这个是重点
      //处理全部
      .........
      firstInterval = setInterval('firstAlert()', 1000*2);
}


function secondAlert(){
	if(secondInterval) clearInterval(secondInterval);//这个是重点

        //处理全部
         .......


        secondInterval = setInterval('secondAlert()', 1000*3);
	}