首页 > 代码库 > R语言igraph 包-构建网络图
R语言igraph 包-构建网络图
igaph 是一个项目，目标是建立一条简单，易用的网络分析工具，有 R, python, C/C++ 等语言的具体实现；
项目主页：
http://igraph.org/
在R语言中，对应的就是 igraph 这个R包
安装：
install.packages("igraph")
使用：
对于图 graph 这种数据结构而言，最基本的元素包括节点（node） 和 边（节点之间的连线，edge）;
igraph 这个R包提供了很多种创建graph的方式，我们先看一个最基本的例子，从数据框创建一个graph；
我们将要创建的graph 如下：
可以看到，这个graph 包括5个节点，首先创建一个数据框，这个数据框中的每一行是一个节点，每一列是节点的属性
代码如下：
> actors <- data.frame(name=c("Alice", "Bob", "Cecil", "David",
"Esmeralda"),
age=c(48,33,45,34,21),
gender=c("F","M","F","M","F"))
> actors
name age gender
1 Alice 48 F
2 Bob 33 M
3 Cecil 45 F
4 David 34 M
5 Esmeralda 21 F
actors 这个数据框保存了图中所有节点的信息，共5个节点，有name, age, gender 3种属性；注意节点的属性是自定义的
接下来创建另外一个数据框，保存边的信息，
代码如下：
> relations <- data.frame(from=c("Bob", "Cecil", "Cecil", "David",
+ "David", "Esmeralda"),
+ to=c("Alice", "Bob", "Alice", "Alice", "Bob", "Alice"),
+ same.dept=c(FALSE,FALSE,TRUE,FALSE,FALSE,TRUE),
+ friendship=c(4,5,5,2,1,1), advice=c(4,5,5,4,2,3))
> relations
from to same.dept friendship advice
1 Bob Alice FALSE 4 4
2 Cecil Bob FALSE 5 5
3 Cecil Alice TRUE 5 5
4 David Alice FALSE 2 4
5 David Bob FALSE 1 2
6 Esmeralda Alice TRUE 1 3
relations 数据框保存了节点之间的连线信息， from， to 两列描述了这条边是从哪个节点到哪个检点，最后的3列是每条边的一些自定义的属性
当两个数据框创建完成之后，就可以利用 graph_from_data_frame 函数创建一个graph, 代码如下：
g <- graph_from_data_frame(relations, directed=TRUE, vertices=actors)
第一个参数是保存edge 信息的数据框，directed 参数控制graph 有无方向，vertices 参数是保存节点信息的数据框
最后进行一个简单的可视化
plot(p)
就可以得到如下所示的图：
上面只是最基本的可视化的例子，对于graph 而言，有directed graph 和 undirected graph 两种，在可视化的时候，最核心的东西是计算每个节点的位置，对于不同类型的graph， 有不同的自动化的布局算法
参考资料：
https://rdatamining.wordpress.com/2012/05/17/an-example-of-social-network-analysis-with-r-using-package-igraph/
R语言igraph 包-构建网络图