1、合并：ArcToolBox—>DataManagement—>Raster—>Mosaic。

　　2、剪切：在ArcMap中，调用空间分析扩展模块，将你感兴趣区的shapefile多边形图层设置为掩膜(空间分析工具条的下拉菜单>option里面设置)，然后在栅格计算器中重新计算一下你的图象，它就会沿掩膜裁出。

ArcGIS教程：ArcGIS栅格数据的合并和剪切