首先在MSDN上看到 4.0 的更新日志中有如下这条：

.NET Framework 4 不能自动使用自己的公共语言运行时版本来运行由 .NET Framework 早期版本生成的应用程序。 若要使用 .NET Framework 4 运行较早的应用程序，则必须使用 Visual Studio 中项目的属性指定的目标 .NET Framework 版本编译应用程序, 或使用应用程序配置文件中的 <supportedRuntime> 元素 可指定所支持的运行时。

解决方案，就是在app.config中添加一个配置节：startup

<?xml version="1.0" encoding="utf-8" ?>
<configuration>
  <startup useLegacyV2RuntimeActivationPolicy="true">
    <supportedRuntime version="v2.0.50727"/>
    <supportedRuntime version="v4.0"/>
  </startup>
</configuration>

在原来.NET2.0，.NET3.5的时候，由于程序运行环境本质还是.NET2.0，而到了.NET4.0由于整个程序集的版本更新，以前使用.NET2.0所编写的程序集与.NET4.0的程序集继续拧互操作的时候就会出现上面所说的兼容性问题。

通过MSDN，我们可以知道，startup配置节中的useLegacyV2RuntimeActivationPolicy属性是在.NET4.0中新增的，默认是false，表示：使用默认的 .NET Framework 4 激活策略，该激活策略将加载 .NET Framework 4 通过使用公共语言运行时 (CLR) 版本 4 所创建的程序集，以及 CLR 早期版本通过使用受支持的低于版本 4 的最高 CLR 版本所创建的程序集。
 

现在如果当程序在.NET4.0环境下要使用.NET2.0及.NET3.5的程序时就必须将useLegacyV2RuntimeActivationPolicy设置为true，同时还要注意，需要在startup配置节的字节中添加supportedRuntime配置节，并指定为"v4.0"，表示使用.NET4.0运行时来运行程序。

(转载) .NET2.0程序集无法在.net 4.0 中运行的解决方案