1.Zen Cart

优点：
历史较久，系统经过长时间充分的测试，比较成熟；
免费开源
便于功能二次开发；
基础功能强大；
安装插件简单，修改文件很少，甚至不用修改文件；
应用非常广泛，插件、模块更新快，其中多为免费；
访问速度快，安装SEO插件后（基础版没有这个功能) 对SEO非常友好，便于搜索引擎优化；
模板和后台分离，便于界面设计的独特性；
具备多语言和多模版功能，即一个模版可以用于一种语言，也可以同时用于其它语言，或每种语言使用其唯一的模板，这样就不会出现因语言不同，文字长短不同而造成的界面混乱了；
购物流程顺畅；
二次开发很简单，所有功能都可以使用插件更新和替换。

缺点：
统较为复杂，后台的功能设置更适宜于程序员思维，对普通人较难；
因为功能强大，因此需要设置的部分就很多，并且很多都很难找到设置的位置；
帮助文档太少，不光是中文，英文帮助文档同样很少，网上找的多数是网友提供的；
界面过于简陋，无论前台或后台；

适用于：
有一定专业知识的人员或程序员
外贸网店

2.Joy-Cart

优点：
免费开源；
ZenCart内核，系统成熟，拥有Zen Cart的所有优点，除随Zen Cart同步升级外，更时时更新中；
懂PHP语言的程序员即可修改；
基础系统功能强大，扩展性好；
功能二次开发很简单，大部分功能都可以使用插件更新和替换；
插件安装简单易行，需要修改的文件很少，通常不用修改即可直接安装；
对ZenCart的最大缺点进行了改进，后台美观的同时，思维逻辑更适宜于普通人，汉化程度高，功能设置连贯，易于查找及使用；
模板和后台分离，模板制作比较简单；
具备多语言和多模版功能，即一个模版可以用于一种语言，也可以同时用于其它语言，或每种语言使用其唯一的模板，这样就不会出现因语言不同，文字长短不同而造成的界面混乱了；
经测速，运行速度优于Zen Cart，对SEO非常友好，便于搜索引擎优化；
购物流程简单顺畅；
整合了多种国外流行的支付及运费方式，例如：Paypal、Master Card、Visa、UPS、USPS等；
公司化经营，多种技术支持通道；
完善的帮助中心及论坛，使用起来更得心应手；

缺点：
后台无法修改订单；

适用于：
后台使用适用于普通用户，修改需要程序员
外贸网店

3.magento

优点：
开源系统；
插件、模块较多，但多为收费版；
界面美观；
功能全面，尤其是属性和价格搜索功能，非常实用；
购物流程顺畅；

缺点：
很多实用功能的收费项目较多；
运行速度慢；
系统较为复杂，后台的功能设置更适宜于程序员思维，对普通人较难；

适用于：
有一定专业知识的人员或程序员
外贸网店

4.ShopEX

优点：

公司化经营；
支持在线、可视化编辑模板；
功能全面；
界面更符合国内购物习惯；
购物流程顺畅；
整合了很多国内常用的运费和支付方式；

缺点：
即便是对程序员来说，修改起来都非常困难，少部份代码经过加密，如果要更改或二次开发，就需要程序高手进行破解才行；
插件非常少；
模板为HTML静态模式，修改需要具备ShopEX的相关专业知识，修改和增加都有一定的难度；
基础版系统是免费的，但如果要插件和别的功能，就要付一笔不菲的费用；
模版少，且多数都是付费模版；
运行速度慢，不利于SEO，如果要做成静态网页（即HTML网页），就需要更改代码；
无法实现多语言（针对系统，如果你是很强的程序员可以改成多语言，就不在此例）；

适用于：
后台使用适用于普通用户，修改需要资深程序员
内贸网店

5.ECShop

优点：
免费开源；
公司化经营；
收费版功能比较全面；
界面更符合国内购物习惯；
购物流程顺畅；
整合了很多国内常用的运费和支付方式；
运行速度快；

缺点：
应该是处于对自身利益的维护，ECshop免费版的后台功能很多，但弱到基本都无法使用，连订单系统都没有包括；
安全性漏洞很多，许多非法代码都可以轻松注入；
插件非常少；
模版少；
前端使用了js框架Mootools对模板的制作限制太多。
即便是对程序员来说，修改起来都非常困难，增加功能和二次开发都比较难；
无法实现多语言（针对系统，如果你是很强的程序员可以改成多语言，就不在此例）；

适用于：
后台使用适用于普通用户，修改需要资深程序员
内贸网店

Zen Cart、Joy-Cart、Magento、ShopEX、ECshop电子商务系统比较