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生信算法实践

最近在搞16S,发现了一个实践算法的最佳机会。

见文章:

A Bayesian taxonomic classification method for 16S rRNA gene sequences with improved species-level accuracy.

文章利用了贝叶斯模型,调用了blast和muscle来对OTU进行taxonomy assignment。

可以看一下源代码,非常简单。

Bayesian-based LCA taxonomic classification method

如果你能彻底理解本文的算法,并能看懂其源码,那你基本就打到了生信算法入门的水平。

说不定以后你也能随手发一个算法的文章哦!

生信算法实践