最可能的原因: 
•    此应用程序在 system.web/httpModules 节中定义配置。 
可尝试的操作: 
•    将配置迁移到 system.webServer/modules 节。也可以手动这样做，或通过在命令行中使用 AppCmd 来这样做 - 例如，%SystemRoot%\system32\inetsrv\appcmd migrate config "Default Web Site/"。使用 AppCmd 迁移应用程序将使它能够在集成模式下工作，并能继续在经典模式下和以前版本的 IIS 上工作。 
•    如果您确信可以忽略此错误，则可以通过将 system.webServer/validation@validateIntegratedModeConfiguration 设置为 false 来禁用它。 
•    也可以将应用程序切换到经典模式应用程序池 - 例如，%SystemRoot%\system32\inetsrv\appcmd set app "Default Web Site/" /applicationPool:"Classic .NET AppPool"。只有在无法迁移应用程序时才这样做。 
(将“Default Web Site”和“Classic .NET AppPool”设置为您的应用程序路径及应用程序池名称) 
链接和更多信息集成模式是在 IIS 7.0 上运行 ASP.NET 应用程序的首选模式

{ IIS 的应用程序池根据托管管道模式分了两种类型：集成和经典两种

集成 .NET 模式下，应用程序不应在 <system.web>/<httpModules> 配置节中指定 ASP.NET 模块组件，而应使用 <system.webServer>/<modules> 配置节来加载 ASP.NET 模块组件。

经典.NET 模式 则是我们以前习惯的IIS 6 的方式，没有上述限制。}

解决方法:

方法1在IIS7上配置应用程序池.

方法2:在IIS7添加我们的模块(modules)

参考:http://aabs.wordpress.com/2007/11/16/ihttpmodule-not-running-after-conversion-to-iis-7-and-net-35/

方法3:修改web.config

再细了解:

IIS7的Application Pools有两种mode，一种是Integrated，一种是classic。如果使用Integrated模式，那么对自定义的httpModules和httpHandlers就要修改配置文件了，需要将他们转移到<modules>和<hanlders>节里去。

IIS7的两种模式和IIS6有什么区别？

IIS7.0 Integrated mode：asp.net的modules和handlers从<system.webServer>下的<modules>和<handlers>里读取，以前的<system.web>下的<httpModules>和<httpHandlers>配置节会被忽略，如果设置禁止验证（disabled validation），是不会产生错误的。

IIS7.0 Classic mode：与以上情况是相反的，<modules>和<handlers>会被忽略。

IIS6.0 ：这个大家都不陌生了。

如果做一个可以在IIS6和IIS7的两种mode下都可以运行的配置？validateIntegratedModeConfiguration=“false”是做什么用的？有需要的朋友可以在这里查看详情。

其次，从iis6迁移到iis7上后，有些url rewrite功能可能就不好用了，下面这篇文章讲述了一个hack方法，有效的控制了staticFile handler的职责，实现了像iis6那样的工作方式。

 示例代码: