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快速求熵程序(续)
这篇blog是对快速求熵程序的数学解释。
首先,还是从熵的计算公式出发,略做一些推导:
$ Entropy=-\sum_{i=1}^{n}P(X_{i})log_{2}P(X_{i})$
$=-\sum_{i=1}^{n}\frac{C(X_{i})}{T}log_{2}\frac{C(X_{i})}{T}$
$=-\frac{1}{T}\sum_{i=1}^{n}C(X_{i})(log_{2}C(X_{i})-log_{2}T)$
$=-\frac{1}{T}(\sum_{i=1}^{n}C(X_{i})log_{2}C(X_{i})-log_{2}T\sum_{i=1}^{n}C(X_{i}))$
$=\frac{1}{T}(Tlog_{2}T-\sum_{i=1}^{n}C(X_{i})log_{2}C(X_{i}))$
令 $f(x)=2^{23}xlog_{2}x$,那么,
$ Entropy=\frac{1}{2^{23}T}(f(T)-\sum_{i=1}^{n}f(C(X_{i})))$
fast_entropy()的代码,就是上面公式的直接实现,其中_lxlogx()即为公式中的$f(x)$。
double fast_entropy(int *counts, int n, int total){ long long s = 0; int i, c; for(i = 0; i < n; i++) { if(c = counts[i]) s -= _lxlogx(c); } s += _lxlogx(total); s /= total; return 0.00000011920929 * s;}
_lxlogx()的代码,只有4行。前3行完成了$2^{23}log_{2}x$的计算,考虑编译后的ASM指令,除了int->float的转换将产生一条FPU的FILD指令外,其余均为整数操作。
static inline long long _lxlogx(int x){ float f = (float)x; int i = *(int *)&f; i += _u[(i & 0x007F8000) >> 15]; return (long long)i * x; }
1个float浮点数占用4字节,按IEEE 754标准格式存储。假设有float浮点数$x$,我们把它的4个字节当做1个32-bit的整数读取,得到$I_{x}$,那么存在近似关系:
$2^{23}log_{2}x\approx I_{x}-2^{23}(127-u)$
这个关系的推导过程见这里。其中,$u (u > 0)$是一个自定义的数,它的数值影响近似程度。具体地,$u$的取值应该尽量让下面的近似误差更小:
$log_{2}(1+x)\approx x + u, (0\leq x < 1, u > 0)$
定义误差函数$e(u)=log_{2}(1+x)- (x+u)$,求解:$\int_{0}^{1}e(u)dx=0$
得到$ u^{*}=0.0573049591110366 $。$e(u^{*})$的图像为,
有没有办法让误差更小呢?可以把$[0,1)$区间分成若干段,为每段找出不同的$u^{*}$。在fast_entropy中,我把$[0,1)$等分成了256个段,对于第 $i (i=0,1,2,...,255)$ 段来说,$u_{i}^{*}$满足:
$\int_{\frac{i}{256}}^{\frac{i+1}{256}}e(u_{i}^{*})dx=0$
计算出256个 $u_{i}^{*}$。
下面图像中,可以看到分段后的误差(紫色)和分段前(蓝色)相比,减小了很多。
这也是fast_entropy中那个_u[256]的来源。当然_u是个32-bit整数数组,每一项是这样计算出来的,
_u[$i$] = $\left [ 2^{32}-2^{23}(127-u_{i}^{*})\right ] $
到这里,fast_entropy所有代码的原理已经解释完毕。
_u数组是控制误差的所在,可以通过增加分段数量,即增加数组大小的方法来提高计算精度,而不会对计算效率产生明显影响。对于大多数实际应用,256项的_u的精度已经足够。
快速求熵程序(续)