http://www.cnblogs.com/ShaneZhang/archive/2013/05/20/3088688.html

从工程上讲，头文件的文件名应该与对应的源文件名相同便于维护，如果头文件中包含了多个源文件中的定义或声明，则应该按源文件分组布局头文件中的代码，并且通过注释注明每组所在的源文件。当一个工程的文件较多时应该将源文件与头文件分开目录存放，一般头文件存放在include或inc目录下，而源文件存放在source或src目录下，根据经验，一个工程的文件数超过30个时应该将源文件与头文件分开存放，当文件较少时直接放到同一目录即可。

其实，C++标准中也没有确定这两种方式搜索文件filepath的顺序，而是由编译器的实现确定，其区别就是如果编译器按照第二种形式定义的顺序搜索文件filepath失败或者不支持这种方式时，将其替换为第一种顺序再进行搜索。

而实际上，一般来讲第一种方式都是先搜索编译器的系统目录，而第二种方式则是以被编译的头文件所在目录为当前目录进行搜索，如果搜索失败再在系统头文件里搜索。这两种方式从本质上讲没有什么区别，但当我们自己的程序文件与系统头文件重名时，用后者就会先搜到我们的头文件而不是系统的。但无论如何，与系统头文件重名都不是一个好习惯，一不小心就可能带来不必要的麻烦，当我们自己编写程序库时，最好把它放入一个目录里，不把这个目录直接添加到编译器的头文件搜索路径中（如gcc的-I, visual c++的/I选项等，其实在UNIX/Linux平台的编译器一般都是-I选项），而是添加到上一级目录，而在我们的源文件中引用该头文件时就包含该目录名，这样不容易造成冲突。

例如，我们创建了一个程序库叫mylib，其中一个头文件是strutil.hpp，我们可以创建一个/home/user/project/src/mylib目录，然后把strutil.hpp放进去，然后把 /home/user/project/src添加到编译选项里：

gcc -I/home/user/project/src

这样，在我们的源程序中可以这样引用strutil.hpp文件：

#include “mylib/strutil.hpp”

通过显示的目录名引用头文件就不容易产生冲突，不容易使我们自己的头文件与系统头文件产生混淆。

当然，从代码逻辑上我们还有另外一种解决冲突的方案，那就是命名空间，详见第[?]节。

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http://blog.sina.com.cn/s/blog_6e0693f70100so42.html

c语言头文件和源文件不在同一个目录