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ASE测试

选择的品种组合为:父本(p1)9311,为籼稻。 母本(p2)12,为粳稻。 后代(f1)F12.

数据为RNA-seq数据。R 代表root, L 代表leaf。

参考基因组选择日本晴。

数据位置:

参考基因组:/share/bioinfo/miaochenyong/call_snp/Osativa_204.fa

p1:/share/bioinfo/miaochenyong/call_snp/parent1/

p2:/share/bioinfo/miaochenyong/call_snp/parent2/

f1:/share/bioinfo/miaochenyong/call_snp/hybrid/