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人體全序列的基因測定

“人類基因組計劃在2003年完成人體全序列的基因測定,但第一代測序方法高昂的時間和經濟成本均令人望而生畏。”江蘇省微納生物醫療器械設計與製造重點實驗室副主任、東南大學機械工程學院副院長陳雲飛介紹,第一代基因測序方法歷時12年、耗資數十億美元,近兩年迅猛發展的第二代測序儀讓人類基因組重測序的費用降低到10萬美元以下,測序時間也縮短到6個月。但是,這樣的價格和時間,對於個人用戶來說仍然太高,因而極大地限制了臨床應用和基礎理論研究。

2004年,美國國家人類基因組研究所啟動了“千元基因組測序研究項目”,目的是讓人類基因組測序費用降至1000美元以下。 2006年,依托東大的江蘇省微納生物醫療器械設計與製造重點實驗室,開展了“基於微納製造的第三代基因測序系統”研究。

“第一代、第二代基因測序使用的都是化學方法,我們採取的是物理方法,重點之一是研製能做納米孔的樣機。”陳雲飛舉了個例子,“DNA在人體細胞裡,就像頭髮絲一樣團成一團,如果能把它們拉直,就能清楚地看到基因序列是如何排列的。”

關鍵問題是,怎麼把DNA序列拉直?陳雲飛說,科研人員想到一個辦法,那就是做一個非常小的孔,就像穿針眼一樣,讓基因從這個小孔裡一一穿過。

  多小的孔才合適呢?陳雲飛說,一根頭髮絲的直徑有7萬納米,而這個小孔的直徑,目標是1納米。

從2000年開始,課題組的科研人員經過反复實驗,選擇了氮化硼和石墨烯作為原材料進行加工。 “目前已經做出2納米直徑的小孔了,可以開始測量短序列基因的測定。”陳雲飛說。

科研人員將納米孔貼在一個膜上,將這個膜插入溶液中,隔開溶液池,通上電極之後,DNA在溶液裡是帶負電的,它就會向正電極一側遊,因為孔很小,鹼基對只能一個一個地從這個孔內過去,通過測定鹼基對經過納米孔時的電流,來確定鹼基對的大小、類型等,完成基因測序。

陳雲飛說,這就像一個人要經過一道門,胖子過去時帶動的風大,瘦子過去時帶動的風就小,人們可以通過測量風的大小來判斷這個人的體型。

據介紹,這項技術的難點在於“針眼”材料的選擇,以及鹼基對通過“針眼”時電流大小的測定。目前,這兩道坎均已被突破,下一步,他們將繼續研究縮小“洞”的大小,提高測序精度、縮短測序時間,爭取在一到兩年內實現“一滴血一天測出人體全基因序列”的目標,縮短找到治療疾病方法的時間。