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R ggplot 作图
R代码:
library(ggplot2) data1<-read.table(file = "cons_spec_gene.xls",header = TRUE,sep = "\t") p<-ggplot(data = http://www.mamicode.com/data1,mapping = aes(x = Group,y = Gene.number,fill = Legend))+geom_bar(stat = ‘identity‘,width = 0.5) q<-p+labs(x="Genome",y="Gene number")+theme_bw()+theme(panel.grid=element_blank(),panel.border=element_blank()) a<-q+theme(panel.border=element_rect(fill=‘transparent‘, color=‘black‘),axis.text.x =element_text (angle=45,hjust=1)) b<-a+coord_cartesian(ylim=c(0,8000)) b
library查看是否安装ggplot;
将目录放入session设置的文件夹,,用read.table打开xls格式的文件,双击tab,自动补充header=TRUE,需要title。分隔符设置为\t读入。
使用ggplot(),双击tab补充参数,依次为读入文件,映射x=group的名,y为gene number数字,fill=Legend的数据,读入y数值属于什么gene的名字,颜色以区分; stat="identity"用来identity提取横坐标x对应的y值,默认一个x对应一个y,width指定宽度。ggplot 的geom_bar 有三种position : stack(默认上下), dodge(左右),fill(百分之百1来作为纵坐标的衡量)。
Labs(x=””,y=””)修改横纵坐标名字+去掉灰色背景+panel.grid/panel.border去掉网格线(所有线都没有了),
Pandel.border加入黑色边框,x轴坐标轴刻度倾斜45度,hjust使刻度下调0.5,
将y轴设置范围为0-8000
8.
先加载包(不加载找不到看不了mpg),查看数据集mpg/mpg$class,以向量取0-36行存入ne‘wdata,无引号,有列名写入x‘l‘s。
像第七题那样读入x‘l‘s文件,加载包,用数据data1,x=displ,y=hwycolor=trans,si‘ze=class,然后+散点图geom_point()
p
输出p
R ggplot 作图
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