首页 > 代码库 > hdu 1080 Human Gene Functions(DP)

hdu 1080 Human Gene Functions(DP)

题意:

人类基因由A、C、G、T组成。

有一张5*5的基因表。每格有一个值,叫相似度。例:A-C:-3。意思是如果A和C配对, 则它俩的相似度是-3【P.S.:-和-没有相似度,即-和-不能配对】

现在给两条基因片段。(长度不一定相等)

现在你要在两条基因片段中插入若干个-(空白基因),使得两个基因片段长度相等,且得到的整体相似度的值最大。【再次P.S.:-和-不能配对】

 

思路:

因为-和-不能匹配,所以插入的-的个数是有限的。

str1的第一个基因可以与str1的第一个或-配对。然后,,,,很快就看到了DP结构,,,

和最长公共子串一样滴的意思,,,

DP方程:dp[i][j]:str1的前i个和str2的前j个能获得的最大相似度值。

看代码,,

 

代码:

int l1,l2;char s1[105], s2[105];int S1[105], S2[105];int a[6][6]={{5,-1,-2,-1,-3},{-1,5,-3,-2,-4},{-2,-3,5,-2,-2},{-1,-2,-2,5,-1},{-3,-4,-2,-1,inf}};int dp[105][105];int maxx(int a,int b,int c){    int t=max(a,b);    return max(t,c);}int main(){    int T;    cin>>T;    while(T--){        scanf("%d",&l1);        scanf("%s",s1);        scanf("%d",&l2);        scanf("%s",s2);        rep(i,0,l1-1){            if(s1[i]==A) S1[i]=0;            else if(s1[i]==C) S1[i]=1;            else if(s1[i]==G) S1[i]=2;            else S1[i]=3;        }        rep(i,0,l2-1){            if(s2[i]==A) S2[i]=0;            else if(s2[i]==C) S2[i]=1;            else if(s2[i]==G) S2[i]=2;            else S2[i]=3;        }        dp[0][0]=0;        rep(i,0,l2-1){            dp[0][i+1]=dp[0][i]+a[4][S2[i]];        }        rep(i,0,l1-1){            dp[i+1][0]=dp[i][0]+a[S1[i]][4];        }        rep(i,1,l1){            rep(j,1,l2){                dp[i][j]=maxx( dp[i-1][j-1]+a[S1[i-1]][S2[j-1]],dp[i-1][j]+a[S1[i-1]][4],dp[i][j-1]+a[4][S2[j-1]] );            }        }        printf("%d\n",dp[l1][l2]);    }    return 0;}

 

hdu 1080 Human Gene Functions(DP)