在stm32F103系列中：AFIO是重映射辅助时钟，如果仅仅是使用第二功能（如uart，spi，），不需要打开，使用第二功能打开GPIO和第二功能时钟。我反复测试是这样的

AFIO时钟由RCC_APB2ENR寄存器的位0控制；

APB2外设时钟使能寄存器(RCC_APB2ENR)  的第0位AFIOEN 辅助功能IO时钟使能在那些时候，需要开启呢？ 
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配置stm32的事件输出/外部中断/重映射的时候.就必须开启AFIO时钟. 
假如使用的管脚里头默认复用的外设功能并不需要开AFIO时钟  

说的很明白，操作AFIO的三类寄存器时需要开启： 
1.事件控制寄存器(AFIO_EVCR)
2.复用重映射和调试I/O配置寄存器(AFIO_MAPR)
3.外部中断配置寄存器x(AFIO_EXTICRx)
这三类其实是AFIO的全部寄存器， AFIO_EVCR是事件相关的，AFIO_MAPR是与重映射和调试I/O相关的，AFIO_EXTICRx是与外部中断相关的。因此管脚重映射和调试I/O配置、外部中断、事件时需开启AFIO。

参考：http://blog.csdn.net/qq_14997473/article/details/47041147

切记：F4系列中并不是这样的

STM32F103 AFIO时钟疑问