linpe包-让发送和接收数据分析更快和更容易
2024-08-16 21:40:04 217人阅读
1.简介
通常在R中从来进行分析和展现的数据都是以基本的格式保存的,如.csv或者.Rdata,然后使用.Rmd文件来进行分析的呈现。通过这个方式,分析师不仅可以呈现他们的统计分析的结果,还可以直接生成pdf和html文件,节省了大量的时间。但是,当你想要给其他人参阅你的文档的时候,你就需要编译.Rmd文件,并且必须要有以下两个文件:
如果可以嵌入分析到数据中并且只需发送一个文件,则会让人感到非常更加简单。而linpe包(作者:Andrea Spanò)实现了该功能,其实现功能描述如下:
简而言之,linpe包为您提供了一套简介的功能,你可以将.Rmd分析作为一个属性嵌入到数据中,然后将结果存为一个对象到一个单一的文件中,发送该文件给需要的用户,该用户可以使用该文件将.Rmd渲染为.pdf或者.html文件。此外,如果接受该文件的人想添加或修改内容,linpe包允许提取并且可以编辑.Rmd文件。
2.如何使用?
2.1创建.Rmd文件
首先,假设您完成了一个分析并且存为.Rmd文件,例如下面的test-linpe.Rmd文件:
--- title: "Test linpe" output: html_document --- ```{r setup, include=FALSE} knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) ``` ```{r, message = FALSE} require(dplyr) require(ggplot2) ``` Do something ```{r} mtcars %>% tbl_df() %>% group_by(cyl) %>% summarise(n = n(), mean_mpg = mean(mpg), sd_mpg = sd(mpg)) ``` Plot something ```{r} ggplot(mtcars, aes(disp, mpg)) + geom_point() ``` |
其显示为HTML文件后为:
2.2安装linpe包
library(devtools) devtools::install_github(‘quantide/linpe‘) library(linpe) |
2.3链接数据
require(linpe) # Link .Rmd to the data using linpe mtcars_linpe <- link(mtcars, file = "test-linpe.Rmd") |
2.4存储为.Rdata文件
# Save the linked dataset as an Rdata file save(mtcars_linpe, file = "mtcars-linpe.Rdata" ) |
2.5加载.Rdata文件
# Reload load("mtcars-linpe.Rdata") |
2.6查询是否为linked数据的linpe对象
# Check name of linpes linpe(mtcars_linpe) ########################## ## Output ########################## # [1] "test-linpe" |
2.7渲染linpe对象
# Render the linpe perform(mtcars_linpe, linpe = "test-linpe") |
2.8提取可编辑的原始.Rmd文件
# Display .Rmd linked to the linpe display(mtcars_linpe, linpe = "test-linpe") |
2.9从data.frame中移除linpe属性
mtcars_linpe <- unlink (mtcars_linpe, linpe = "test-linpe") linpe(mtcars_linpe) ########################## ## Output ########################## # No limpe in mtcars_linpe # character(0) |
3.linpe包函数介绍
link
link(data, file, linpe = NULL) data 一个数据框对象 指.Rmd文件中使用的数据集 file 字符串向量,指向一个.Rmd文件位置 linpe 字符串向量,提供了linpe(分析)的名称,当没有指定的话,使用默认值设置为NULL,则该linpe名称由file参数指定的文件名推导出,即去掉文件类型后缀(.Rmd) |
示例:
file <- paste(find.package("linpe"), "rmd/test-linpe.rmd", sep = "/") # analysis is saved with default name mtcars_linpe <- link (mtcars, file = file) attr(mtcars_linpe, "test-linpe") # analysis is saved with specific name mtcars_linpe <- link (mtcars, file, linpe = "this-linpe") attr(mtcars_linpe, "this-linpe") |
unlink
unlink(data, linpe) data 一个数据框对象 指.Rmd文件中使用的数据集 linpe 字符串向量,提供了linpe(分析)的名称 file <- paste(find.package("linpe"), "rmd/test-linpe.rmd", sep = "/") mtcars_linpe <- link (mtcars, file = file) linpe(mtcars_linpe) mtcars_linpe <- unlink (mtcars_linpe, linpe = "test-linpe") linpe(mtcars_linpe) |
display
display(data, linpe) data 一个数据框对象 指.Rmd文件中使用的数据集 linpe 字符串向量,提供了linpe(分析)的名称 返回值: invisible(NULL) and, as side effect, opens the ‘.rmd‘ linked to the linpe 示例: data(mtcars_linpe) display(mtcars_linpe, linpe = "test-linpe") |
linpe
linpe(data) data 一个数据框对象 指.Rmd文件中使用的数据集 返回值: list of linpes associated to data 示例: data(mtcars_linpe) linpe(mtcars_linpe) linpe(mtcars) |
perform
Perform(data, linpe, ...) data 一个数据框对象 指.Rmd文件中使用的数据集 linpe 字符串向量,提供了linpe(分析)的名称 ... any parameter to be passed to function rmarkdown::render 返回值: invisible(NULL) and, as side effect, renders the ‘.rmd‘ file corrensponding to the analysis and display it in the default html viewer 示例: data(mtcars_linpe) perform(mtcars_linpe, "test-linpe") |
4.英文原文
http://www.quantide.com/linpe-make-sending-receiving-data-analysis-faster-easier/
linpe包-让发送和接收数据分析更快和更容易
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